Az amplifikált fragmensek hosszpolimorfizmusa

Az amplifikált fragmensek hosszúsági polimorfizmusa vagy az AFLP (angol rövidítés az amplifikált fragmens-hosszúságú polimorfizmushoz ) a genetikai és a transzgenesisben alkalmazott eszköz .

Műszaki

A genomi DNS- t két restrikciós enzimmel emésztettük , az egyik ritkán vágott (az ábra EcoR1-t említ, de Pst1-et használtunk), a másik gyakrabban vágott (itt MSE1, amely ugyanazon a helyen vágja a TRU1-et). Ezután adaptereket adunk a hasítási helyek végeihez, hogy a primerek a fragmensekhez kapcsolódhassanak.

A DNS mennyiségének növelése érdekében az összes fragmenst (degenerált primerek) előerősítjük. Ezután a szelektív PCR- amplifikáció lehetővé teszi a fragmensek számának növelését. Az akrilamid gélen ezért több tíz fragmens (általában 500 és 100 bp között) láthatóvá válik egyetlen PCR-ben, majd egyetlen gélben, a faj előzetes ismerete nélkül. A polimorfizmusok viszonylag gyakoriak.

Kapcsolódó cikkek