Az exonok keverése olyan molekuláris mechanizmus, amely új gének képződését teszi lehetővé. Ez egy olyan folyamat, amelynek során két vagy több, különböző génekből és nem homológ kromoszómából származó exon egyesül . Ugyanez az exon megismételhető, és így új exon- intron struktúrát hozhat létre . Különböző mechanizmusok léteznek az exon-keveredés során: transzpozon által közvetített exon-keverés , keresztezés a szülői genom rekombinációja során vagy illegitim rekombináció. Az exonok keverése bizonyos összekapcsolási szabályokat követ.
Walter Gilbert 1978-ban említette először az exon keverését, amikor felfedezte, hogy az intronok megléte nagy szerepet játszhat a fehérjék evolúciójában . Megjegyezték, hogy az intronok középpontjában lévő rekombináció függetlenül elősegítheti az exonok választékát. Ezenkívül az ismétlődő szegmensek jelenléte az intronok közepén a rekombináció szempontjából kedvező területeket hozhat létre az exonok keverése érdekében. Ezeknek az intronoknak az eukariótákban való jelenléte és a prokariótákban való hiánya azonban vitát váltott ki arról, hogy ezek az intronok mikor jelentek meg. Két elmélet alakult ki: az egyiket angolul "korai intronnak", és "késői intronnak" nevezték. Azok, akik támogatják a "korai intron" elméletet, úgy vélik, hogy az intronok és az RNS splicingjei csak a RNS-re épülő világ relikviái lennének, ezért a prokarióták és az eukarióták mindegyikében vannak intronok. Ezt követően a prokarióták megsemmisítették az intronokat a jobb hozam érdekében, míg az eukarióták megtartották az intronokat és őseik plaszticitását . Ugyanakkor azok, akik támogatják a "késői intron" elméletet, úgy vélik, hogy a prokarióták génjei közel állnak az ősi génekhez, és hogy az intronok később megjelentek az eukarióták génjeiben. Ettől a két elmélettől függetlenül egyértelmű, hogy az exon-intron szerkezet, amely kizárólag az eukariótákban van jelen, nincs rögzítve; az intronokat folyamatosan illesztik be és távolítják el a génekből, és az intronok evolúciója párhuzamos az exon-keverés evolúciójával.
A prophase a meiózis , a homológ kromoszómák tulajdonítanak egymásnak, és ez ebben az időben, hogy a cross-over kerülhet sor . De lehetséges, hogy ekkor hiba lép fel, és az átrendeződés ugyanazon kromoszóma két génje között történik. Ezután géncserét folytatunk. A legújabb kutatások szerint más mechanizmusok származhatnak az exonok keveredéséből, mint például a helitronok vagy az úgynevezett LTR szekvenciák. Azonban további kutatások szükségesek ezekről a témákról, hogy megerősítsék részvételüket az exon keverésében.
Példaként említhetjük a tpa gént , amely a szöveti plazminogén aktivátort kódoló gén . Ez a gén szerepet játszik a véralvadás korlátozásában. Úgy gondolják, hogy ez a gén az ősi exonok keverésének és megkettőzésének eredményeként jött létre.