A molekuláris markerek egyfajta genetikai marker, amely DNS- fragmensekből áll , amelyek referenciaértékként szolgálnak a kromoszómaszegmens egyik generációról a másikra történő átvitelének nyomon követésére . Így, ha az egyén által hordozott X allélt az apja hordozza, de az anyja nem, az egyén apjától kapta. Ennek az X allélnek a molekuláris markerei lehetővé teszik ennek az allélnek a szülői eredetét. Ezért bizonyos molekuláris markerek felhasználhatók a szülői vizsgálatok elvégzésére .
A molekuláris markereket az agronómiában növények javítására is használják. Lehetővé teszik a vetőmag vagy a palántanövény jövőbeni agronómiai jellemzőinek, például a hozam, a biomassza stb.
A morfológiai, fiziológiai vagy biokémiai jellemzőkkel társított markerekkel ellentétben a molekuláris markerek közvetlenül felfedik a genetikai örökség módosulásait, függetlenül attól, hogy fenotípusos ( fenotípusos ), fiziológiai vagy biokémiai változásokat eredményeznek-e . Ezek a molekuláris markerek tehát a genetikai variabilitás semleges indikátorai, amelyek lehetővé teszik a családok, nemzetségek, fajok, fajták, populációk és akár az egyének közötti polimorfizmus azonosítását is ... Így a molekuláris markerek nagyon hatékony eszközök a molekuláris filogenetikában, mivel rokoni kapcsolatokat teremthetnek egymás között. egyének.
A molekuláris jelölési stratégiák többsége pontmutációkat detektál a DNS-szekvenciában (például AFLP (Amplified fragment length polymorphism), RFLP (Restriction fragmens length polymorphism, Restriction fragment length polymorfism ) technikák ) vagy SNP (Single nukleotid polymorphism) vagy az a nagyon rövid ismétlődő mikroszatellit típusú motívumok példányainak száma A genetikai örökség változásainak harmadik kategóriája a transzponálható elemek ( transzpozon ) jelenlétéhez és aktivitásához kapcsolódik .