A filogenetikai hálózat egy olyan grafikon, amelyet a fajok vagy organizmusok közötti evolúciós kapcsolatok vizualizálására használnak. Akkor kell használni, ha hibridizáció , horizontális géntranszfer vagy genetikai rekombináció fordul elő . Ilyen evolúciós események hiányában is hasznosak lehetnek a filogenetikai hálózatok, például több filogenetikai fa (fák, amelyek egyébként a filogenetikai hálózatok részhalmazát alkotják) konszenzusának képviseletében .