Haplogroup H (mtDNS)

A haplocsoporttal H egy haplocsoporttal a mitokondriális genom az emberi genetika . Különösen elterjedt Európában, ahol állítólag a lakosok 40% -ának van ilyen típusú mitokondriuma, de ez a Földközi-tenger körül és a Kaukázusban található, Kelet-Afrika és Közép-Ázsia felé tolva. A H. különböző alcsoportjai vannak.

Történelem

Úgy tűnik, hogy története összefügg az R1b haplocsoportéval, az Y kromoszóma haplocsoportjával, amelyről azt gondolják, hogy több mint 20 000 évvel ezelőtt jelent meg. Elterjedési területeik valóban hasonlóak. Úgy gondolják, hogy a klád körülbelül 20-25 ezer évvel ezelőtt Délnyugat-Ázsiából származott.

Először a Közel-Kelet északi részén és a Dél- Kaukázusban alakult ki 33 és 26 000 évvel ezelőtt, és az Ibériai-félszigetről érkező későbbi vándorlások arra utalnak, hogy a klád az utolsó jégkorszak maximuma előtt , alig több mint 20-25 ezer évvel ezelőtt ért el Európába . A haplocsoport elterjedt Afrika, Szibéria és Ázsia belső területein is. Ma az összes anyai vonal mintegy 40% -a tartozik a H haplocsoportba.

Különösen Európa atlanti partján ( különösen a baszkok lakosságának 50% -áig ), valamint Szardínián és a Skandináv-félsziget déli részén található, mégis kiterjed Maghrebre és Kelet-Európára, bár kisebb mértékben (10% körüli).

I. Napóleon , a francia császár (1769-1821) és Victoria királynő hordozói ennek a genetikai profilnak.

Jellemzők

A H1 és H3 alhaplocsoport filogeográfiai mintázata szorosan hasonlít az V. haplocsoportra. A csillag alakú filogenitás, a földrajzi eloszlás és a három klád hozzávetőleges kora azt sugallja, hogy valamennyien részt vettek egy délnyugatról északkelet-Európára kiterjedő nagy terjeszkedésben, körülbelül 12 000–14 000 év alatt. ezelőtt. A H1 és H3 az Ibériai-félsziget H-haplocsoportjának mintegy 65% ​​-át, északnyugaton körülbelül 46% -át, Közép- és Kelet-Európa országaiban körülbelül 27% -át, a Közel-Keleten és a Kaukázusban pedig körülbelül 5% -át 15% -ig képviselik, majd az öbölben nulláig. Ez a két alosztály tehát mintegy 13 000 évvel ezelőtt Délnyugat-Európa magdaléniai terjeszkedésével társult .

A Haplogroup H (2706, 7028) H1 és H3 alosztályait sokkal jobban tanulmányozták, mint a többieket.

Alosztályok

A H1 alcsoportba tartozó 3750-ből körülbelül száz egyén mutat vissza Back Mutation nevű regressziót. Azonban nem egy egyének csoportjáról (klaszterről) lehet szó, amely alosztály kialakulását eredményezheti. Ez egy aminosavak és nukleotidok mutációja a DNS-ben, amely a ciszteint (C) treoninnal (T) helyettesíti a kodonokban. 2010-ben a H1 alcsoport legnagyobb gyakoriságát a líbiai Fezzan régióban élő tuaregeknél találták (61%). Az alapvető H1 * haplocsoport a mali Gossi régióban élő tuaregek körében található (4,76%)

  • H4b: Iránban figyelhető meg.
  • A H5 a Kaukázusban gyakori, de a Földközi-tenger környékén alacsonyabb, és Anatóliától az Alpokig a Dunán keresztül magasabb frekvencia utal a mezőgazdaság (G2a stb.) Vagy a R1b-L23. A H5 Haplogroup Európa-szerte és a Földközi-tenger környékén a Közel-Keletig is kiterjed, de különösen az Alpokban, Walesben, Szlovákiában és még Lettországban is jelen van, anélkül, hogy meghaladja a népesség 10% -át. A szubpopulációjában a Franco-kantábriai régióban a haplocsoport H5 + 16192 lehet őshonos Észak-Spanyolországban, különösen Asturias . Ez egy nagyon hegyvidéki régió, amely a XX .  Századig történelmileg elszigetelt . A H5 + 16192 Haplogroup az asztriai népesség 1,86% -át képviseli, és ezeknek körülbelül 25% -a osztozik a kérdéses mutációban

    • A H10e haplocsoportot egy neolitikum helyszínén fedezték fel, amelyet Bom Santo barlangként azonosítottak Lisszabon közelében , Portigalban. Ez a legrégebbi H10-minta, amelyet valaha felfedeztek, és amely Kr.e. -3735 körüli, körülbelül 45 éves dátummal rendelkezik.

    Fa szerkezete

    A H haplocsoport alosztályainak ez a filogenetikai fája a 16-os (2014 február) Phylotree, nemzetközileg elfogadott szabvány. A teljes fa a Phylotree-nél látható.

    Megjegyzések és hivatkozások

    1. Luísa Pereira , Martin Richards , Ana Goios és Antonio Alonso , „  Nagy felbontású mtDNS bizonyíték Európa késő jégkori visszatelepítésére egy ibériai menekültről  ” , Genomkutatás ,2005. január( ISSN  1088-9051 , PMID  15632086 , DOI  10.1101 / gr.3182305 , konzultáció 2018. február 11 - én ) ,p.  19–24
    2. [1] , Roostalu et al., 2006
    3. (in) A genetikai kronológia az indiai szubkontinensen pont erősen torzított szex szétszóródások , BMC Evolúciós Biológia , Volume 17, cikk szám: 88, 2017
    4. (a) Konstantina Drosou et al., Az első a doboz Számolt szokatlan mitokondriális haplotípust H4a1 az ókori Egyiptom , Sci Rep. , 2020. október 12., 10 (1): 17037, doi: 10.1038 / s41598-020-74114-9.
    5. Homo sapiens H5a1 haplocsoport mitokondrium
    6. Behar DM, van Oven M, Rosset S, Metspalu M, Loogväli EL, Silva NM, Kivisild T, Torroni A, Villems R, "  Az emberi mitokondriális DNS fa gyökérzetéből származó újbóli értékelése  ", American Journal of Human Genetics , vol.  90, n o  4,2012. április, P.  675–84 ( PMID  22482806 , PMCID  3322232 , DOI  10.1016 / j.ajhg.2012.03.002 )
    7. António Faustino de Carvalho , Bom Santo-barlang (Lisszabon) és Portugália déli részének középső neolit ​​társadalmai , Faro, Universidade do Algarvede.,2014, 256  p. ( ISBN  978-989-97666-3-1 , OCLC  946.308.166 )
    8. Vanesa Álvarez-Iglesias et al., „Az  R0 mitokondriális DNS makro-haplocsoportban a belső variáció új populációja és filogenetikai jellemzői  ” ,2009. április 2( PMID  19340307 , PMCID  2660437 , DOI  10.1371 / journal.pone.0005112 ) , e5112
    9. Ennafaa H, Cabrera VM, Abu-Amero KK, González AM, Amor MB, Bouhaha R, Dzimiri N, Elgaaïed AB, Larruga JM, „  Mitochondrial DNA haplogroup H structure in North Africa  ”, BMC Genetika , vol.  10,2009. február, P.  8 ( PMID  19243582 , PMCID  2657161 , DOI  10.1186 / 1471-2156-10-8 )
    10. Roostalu U. és munkatársai: „A  H haplocsoport, a domináns emberi mitokondriális DNS-vonal keletkezése és terjeszkedése Nyugat-Eurázsiában: a közel-keleti és a kaukázusi perspektíva  ” , Molecular Biology and Evolution ,2007. február 24( PMID  17099056 , DOI  10.1093 / molbev / msl173 ) ,p.  436–48
    11. (in) "  PhyloTree.org mtDNA R0 alfa  " ( Archívum • Wikiwix • Archive.is • Google • Mit kell tenni? )

    Lásd is

    Filogenetikai fa haplocsoportok a mitokondriális DNS (mtDNS) humán.

      Mitokondriális Éva ( L )    
    L0 L1–6
    L1 L2 L3   L4 L5 L6
      M   NEM  
    CZ D E G Q   O NÁL NÉL S   R   én W x Y
    VS Z B F R0   JT előtti P  U
    H V JT K
    H V J T