A fehérje-domén egy része egy fehérje , amely képes elfogadása szerkezet önállóan vagy részben autonóm módon a molekula többi részét. A fehérjék szerkezetének moduláris eleme, amely így ezeknek a doméneknek a többségéből összeállhat. Ezt hívják multidomain fehérjének.
A fehérje domének általában kompakt és stabil szerkezetet alkotnak, és néha függetlenül is előállíthatók (géntechnológiával, proteolitikus hasítással stb.). A teljes fehérje bizonyos specifikus funkcióit hordozhatják : ligandumok megkötése , kölcsönhatás más makromolekulákkal, katalitikus hely stb.
Egy adott fehérje-domént általában háromdimenziós szerkezete és bizonyos számú aminosav jellemez, amelyek az elsődleges szerkezetében konzerválódnak. Ugyanaz a fehérjetartomány jelen lehet a különböző fehérjékben (lásd az ábrát), különböző funkciókkal. A fehérjék e doménekké történő moduláris szervezése a molekuláris evolúció egyik eszköze, amely lehetővé teszi, hogy a fehérjék sokféleségének felépítéséhez építőelemként kombinálva használják őket.
A fehérje domén meghatározása tehát három fogalom köré tagolódik: a szerkezet alapegysége, a funkció alapvető egysége, a hajtogatás alapegysége .
A fehérje domén tipikus mérete 30 és 500 aminosav között mozog, átlagosan körülbelül száz aminosav.
Az intermedierek létezését az egyes fehérje monomerek hajtogatásában Michel Goldberg bizonyította 1969-ben, aki „globulákként” jelölte meg a polipeptidláncok ezeket a régióit, amelyek autonóm módon hajtódnak össze, a nukleációs központok körül, függetlenül a teljes harmadlagos szerkezet kialakulása előtt. a fehérje. 1973-ban hasonló modellt javasolt Donald B. Wetlaufer "domain" néven, ezt a kifejezést végül átvették.
A fehérje domének sokfélesége van, de ennek ellenére korlátozottabb, mint a teljes fehérjéké. Egyes becslések csak néhány ezer lehetséges struktúra számát vetik fel egy globuláris tartományra vonatkozóan. E területek felépítésében felismerhetünk ismétlődő elemeket, amelyek lehetővé tették a besorolást.
Bizonyos domének nagyon gyakoriak és nagyon sok fehérjében vannak jelen. Az RNS felismerési motívumot vagy az RRM domént tehát nem kevesebb, mint 928 fehérje szekvenciájában találták meg, amelyeket az emberi genom kódol .