In silico

Az In silico (amelynek szó szerinti francia nyelvű fordítása szilícium-dioxidon van )latin ihletésű neologizmus, amely komplex számítógépes számítások vagy számítógépes modellek segítségével végzett kutatást vagy esszét jelöl.

Ezt a kifejezést elsősorban a genomika és a bioinformatika területén használják .

A neologizmus etimológiája és története

A kifejezés neologizmus (nem latinul használták), amelyet 1989-ben találtak volna fel , az in vivo (franciául "az életben"), in vitro ("kémcsőben"), méhben (szó szerint "a méhben") vagy in situ ("a helyszínen") latin kifejezések analógiájával . gyakran használják egy vagy több élő organizmus bevonásával végzett kísérlet végrehajtásának leírására; ez a szilíciumra utal , amely a számítógépekben használt tranzisztorok alapvető eleme .

G. Gallezot (a GRESI kutatója, Információs Szolgáltatások Kutatócsoportja) szerint; szerint „a keresés a címek és összefoglalók a cikkek hivatkozott PubMed  ” , akkor már használják a szakirodalomban először a 1991 , a dán mikrobiológusok a felülvizsgálat során az Institut Pasteur . Ezután 1993-ban három másik cikkben használták , majd 1996- tól széles körben elterjedt .

Gyógyszerfejlesztés

Mivel az in silico kutatás előállítja és előminősíti a potenciális gyógyszereket, képes arra, hogy felgyorsítsa a felfedezés sebességét és csökkentse a drága laboratóriumi kísérletek vagy klinikai vizsgálatok szükségességét. 2010-ben például a kutatók algoritmust alkalmaztak, hogy in silico- ban megtalálják a rák aktivitásával összefüggő enzim lehetséges inhibitorait, amelyek 50% -a később a laboratóriumban valódi inhibitornak bizonyult. Ez a megközelítés eltér a nagy áteresztőképességű szűrő laboratóriumokétól, ahol naponta több ezer vegyületet tesztelnek fizikailag, alacsonyabb sikeresség mellett.

Sejtmodellek

Erőfeszítéseket tettek a sejtes viselkedés számítógépes modelljeinek létrehozására.

Például 2007-ben a tuberkulózis elleni küzdelem kutatói kifejlesztették ennek a betegségnek az in silico modelljét , amely lehetővé teszi bizonyos tények fejlődésének szimulálását hónapok helyett néhány perc alatt. Ez a munka azonban nem képviseli az egész sejt viselkedésének teljesen pontos modelljét. A molekuláris dinamika és a sejtbiológia megértésének korlátai a számítási kapacitás hiánya mellett egyszerűsítő feltételezésekhez vezetnek, amelyek korlátozzák a jelenlegi in silico modellek hasznosságát .

Genetikai

A digitális genetikai szekvenálás tárolható adatbázisban , tanulmányozható, digitálisan módosítható, és sablonként felhasználható az "új DNS" létrehozására a "mesterséges gének" szintézisén keresztül.

Foglalkoztatás

Az in silico- t széles körben alkalmazzák a bioinformatikában , például olyan gének keresésére, amelyek in silico-ban végezhetők géndetektáló programok segítségével, majd in situ a számítógépes előrejelzések kísérleti validálásához.

Megjegyzések és hivatkozások

  1. Gallezot, G. (2002). Kutatás in silico . kutatók és digitális dokumentáció, 229-253 (PDF, 25 oldal)
  2. Hansen és mtsai. In: Kutatás a mikrobiológiában, vol. 142, 2–3., 161–167
  3. Röhrig, Ute F. Awad, Loay; Grosdidier, AuréLien; Larrieu, Pierre; Stroobant, Vincent; Colau, Didier; Cerundolo, Vincenzo; Simpson, Andrew JG et al. (2010). „Indoleamine 2,3-Dioxigenase Inhibitorok Racionális Tervezése”. Journal of Medicinal Chemistry 53 (3): 1172–89. doi: 10.1021 / jm9014718. PMID 20055453 .
  4. Ludwig Rákkutató Intézet (2010. február 4.). Új számítási eszköz a rák kezelésére. ScienceDaily. Letöltve 2010. február 12-én a http://www.sciencedaily.com/releases/2010/01/100129151756.htm webhelyről
  5. Surrey Egyetem (2007, június 25.). In Silico Cell a TB kábítószer-felfedezéshez. ScienceDaily. Letöltve: 2010. február 12., A http://www.sciencedaily.com/releases/2007/06/070624135714.htm

Lásd is

Kapcsolódó cikkek

Bibliográfia