Mikrokokális nukleáz

Mikrokokális nukleáz Mikrokokális nukleáz kriogén hőmérsékleten ( PDB  3H6M ) Kulcsadatok

EK sz.	EK 3.1.31.1
CAS-szám	9013-53-0

Enzimaktivitás

IUBMB	IUBMB bejegyzés
IntEnz	IntEnz nézet
BRENDA	BRENDA bejárat
KEGG	KEGG bemenet
MetaCyc	Metabolikus út
PRIAM	Profil
EKT	Szerkezetek

A nukleáz mikrokokkusz ( enzim megbízási szám: 3.1.31.1 ) egy endo - exonukleáz, amely előnyösen az egyszálú nukleinsavakra termel mononukleotidokat és oligonukleotidok 3 '- foszfátot. Ennek az enzimnek a kivágási sebessége 30-szor nagyobb, ha egy adenin vagy timin 5'-végére hat, összehasonlítva a guaninnal vagy a citozinnal . Ennek az enzimnek van aktivitása az RNS és a kettős szálú DNS ellen is , ami végül az összes szekvencia hasítását eredményezi.

Szinonimák

Ezen enzim egyéb megnevezései: mikrokokokkusz-nukleáz, S7-nukleáz, MNáz, lép-endonukleáz, termonukleáz, T-nukleáz, mikrokokkusz-endonukleáz, T'-nukleáz, staphylococcus-nukleáz, lép-foszfodiészteráz, Staphylococcus aureus nukleáz, Staphylococcus nukleáz (dezoxinukleát)

Jellemzők

Ennek az enzimnek a molekulatömege 16,9 KDa , és szigorúan Ca 2+ -függő. Optimális pH-ja a Ca 2+ koncentrációjától függően változik, ezért az EGTA komplexképző szer könnyen inaktiválja.

Forrás

Ez az enzim a Staphylococcus aureus extracelluláris nukleáza . Két törzs, a V8 és a Foggi termeli ennek az enzimnek gyakorlatilag azonos formáját. Gyakori termelési forrás az Escherichia coli rekombináns törzse, amely rendelkezik a staphylococcus nukleáz génnel.

Szerkezet

A mikrokokus nukleáz (amelyet akkor nukleák staphyilococcale néven ismertek) háromdimenziós struktúrája 1969-ben feloldódott, ami a fehérjék röntgenkristályográfiájának történetében az egyik első eredmény , azáltal, hogy a Protein Data Bankra rakták le az 1SNS archív kóddal (már elavult). Újabb és nagy felbontású struktúrák állnak rendelkezésre az apolipoprotein formához (PDB 1SNO kód) és a timidin-difoszfáthoz kapcsolt gátolt formához ( PDB  3H6M 3H6M vagy PDB  1SNO 1SNC kódok )

Amint a fenti szalagdiagramból látható, ennek a nukleáznak a molekulája 3 alfa hélixszel és öt láncból álló hordó alakú bétalappal rendelkezik, az OB hajtásnak nevezett elrendezéssel ( oligonukleotid-kötéssel , azaz oligonukleotid-fixálóval angolul) ), a fehérjék szerkezeti osztályozása (SCOP) adatbázisának osztályozása szerint.

Alkalmazások

• A nukleinsavak hidrolízise nyers sejtkivonatokká.
• Az RNS szekvenálása (a DNS lebomlása miatt)
• Nyúl retikulocita lizátumok előállítása .
• Kromatinszerkezeti vizsgálatok .
• A nukleinsavak ablációja a fehérje készítményekből a laboratóriumban, lehetővé téve a háromdimenziós fehérje konformációk és a szerkezet-funkció összefüggések tanulmányozását.
• A fehérje hajtogatási mechanizmusainak kutatása .

Megjegyzések és hivatkozások

1. Heins JN, Suriano JR, Taniuchi H, Anfinsen CB (1967).
2. Cusumano CL, Taniuchi H, Anfinsen CB (1968).
3. Arnone A, Bier J és mtsai. (1971).

• http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/micrococcal-nuclease/ (angol)

• http://www.worthington-biochem.com/nfcp/default.html (angol)

• http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en0181-usa-msds.pdf - Termékbiztonsági szabványlap (angol nyelven)

• http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en018-product-information.pdf - Termékinformációs lap (angol nyelven)

Külső linkek

• (in) MeSH Micrococcal + Nuclease : Micrococcal + Nuclease (angol nyelven)
• EK 3.1.31.1 nómenklatúra