Összehasonlító genomika

Az összehasonlító genomika a különböző fajok genomjainak szerkezetének és működésének összehasonlító vizsgálata . Lehetővé teszi a szelekció genomok szerveződésére és evolúciójára gyakorolt ​​hatásainak azonosítását és megértését . Ez az új kutatási vonal profitál a szekvenált genomok számának növekedéséből és a számítógépes eszközök erejéből. Az összehasonlító genomika egyik fő alkalmazási területe a gének és nem kódoló szabályozó szekvenciáik felfedezése a konzerváció elvén alapulva.

Közös gének

A DNS-szekvenálás feltárta, hogy az emberi genom körülbelül 8% -a eredeti retrovírusos szekvenciákból áll . Ezek az endogén retrovírusok az ősi vírusintegrációk maradványait jelentik, amelyek ma már az emberi genom részét képezik. Ezeknek a szekvenciáknak a többségén számos evolúciós mutáció ment keresztül, amelyek a retrovírust általában hibássá tették , de egyesek megőrizték fertőző erejüket, sőt szerepet játszanak bizonyos , az emberi szaporodáshoz és fejlődéshez kapcsolódó fiziológiai aspektusokban is (például az emberi HERV-W , amely részt vesz a placenta kialakulását biztosító mechanizmusok egyikében ).

Ez a szekvenálás azt is feltárta, hogy az állatok és a növények gének legalább 25% -át megosztják.

A szekvenálás azt is megmutatja, hogy a modern emberek például a neandervölgyiekkel közös gének 99,7% -ában , a csimpánzban a gének 98% -ában, a makákóban 93% -ban, az egérben 85% -ban, a tehénben, macskában 80% -ban vagy kutya, 70% tengeri sün, 61% gyümölcslégy , 60% csirke, 43% féreg, 40% banán, 35% nárcisz, 25% saláta vagy rizs. Az emberek 26% -a osztozik génjeik élesztővel és 18% a gomb gomba .
Ezek a genetikai távolságra vonatkozó adatok azt mutatják, hogy minden élő fajnak sok közös vonása van (a fenotípus a vertikális, de a horizontális géntranszferekből származó genetikai örökség kifejeződése is), különösen a fenntartásban és az expresszióban részt vevő gének szintjén anyagcserében és a környezet észlelésében, de ezeket még perspektívába kell helyezni, mert a számítások csak azokra a kódoló génekre vonatkoznak, amelyek csak az emberi genom 5% -át (és az emberi genom kevesebb mint 2% -át teszik ki) fehérjét kódol). Ezenkívül a nagy hasonlóság a genotípus szintjén nem feltétlenül jár együtt nagy hasonlósággal a fenotípus szintjén. Ez utóbbi a környezet adott genotípusra gyakorolt ​​hatásából származik, amely jelentős eltéréseket eredményez (a fenotípusos plaszticitás fogalma ). Ez genetikai különbségekből is adódik, amelyek lokalizálódnak a DNS funkcionális aktivitás helyeinek meghatározásában. Végül sok biológiai tulajdonság nem egyetlen gén, hanem több gén aktivitásának eredménye. Nem a genetikai távolság, hanem a gének kombinatorikus és hierarchikus jellege, és valószínűleg bizonyos epigenetikai adatok hozzák létre az élőlények sokféleségét.

Az emberi genom összetétele

Az emberek származását genomi aláírásuk tükrözi. A filogenetikai elemzés A humán genom azt mutatja, hogy a 23.000 emberi gének, genetikai homológiát visszamegy prokarióták számára 37% -át, hogy egysejtű eukarióták 28%, hogy az állatok 16%, a gerincesek számára 13%, és a specifikus a főemlősök 6%.

Megjegyzések és hivatkozások

Megjegyzések

Hivatkozások

  1. Anne-Geneviève Marcelin és Vincent Calvez (Jean-Marie Huraux irányításával), Az orvosi virológia értekezése , Párizs, Éditions Estem, 2003, 699  p. ( ISBN  2-84371-203-3 ) , „Feltörekvő emberi retrovírusok”, p.  615
  2. (in) T. Domazet-Loso, D. Tautz, "  Az emberi genetikai betegségekhez kapcsolódó gének ősi evolúciós eredete  " , Mol Biol Evol , vol.  25, n o  12,2008, P.  2699–2707.
  3. (in) ES Lander et al., "  Az emberi genom kezdeti szekvenálása és elemzése  " , Nature , vol.  409, n o  6822,2001. február 15, P.  860–921.
  4. (in) Darbeshwar Roy, biotechnológia , Alpha Science International,2010, P.  28..
  5. .
  6. Alastair Crisp, az Egyesült Királyság Cambridge-i Egyetemének biológusa szerint: „Az élet fája tehát nem a tökéletesen elágazó ágú, széles körben képviselt fa. Valójában inkább egy fojtogató füge , kusza gyökerekkel ” . vö. (en) Alastair Crisp †, Chiara Boschetti †, Malcolm Perry, Alan Tunnacliffe, „  A több vízszintesen megszerzett gén expressziója mind a gerinces, mind a gerinctelen genom jellemzője  ” , Genome Biology , vol.  16, n o  50,2015( DOI  10.1186 / s13059-015-0607-3 ).
  7. (in) Mihaela Pertea, "  Az emberi genom eukromatikus szekvenciájának befejezése  " , Genova , repülés.  3, n o  3,2012. június 2, P.  344–360 ( DOI  10,3390 / gének3030344 ).
  8. Bernard Swynghedauw, amikor a gén ütközik a környezetével , Armando Editore,2009, P.  15.
  9. emberi származást a genomi aláírás tükrözi, az ábra Margaret McFall-Ngaia et al. , 2013
  10. (in) Margaret McFall-NGAIA munkatársai, "  Állatok bakteriális világ, egy új elengedhetetlen az élettudományok  " , Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.  110, n o  9,2013. február 26, P.  3229–3236 ( DOI  10.1073 / pnas.1218525110 ).

Lásd is

Kapcsolódó cikkek

Bibliográfia

Külső linkek