Összehasonlító genomika
Az összehasonlító genomika a különböző fajok genomjainak szerkezetének és működésének összehasonlító vizsgálata . Lehetővé teszi a szelekció genomok szerveződésére és evolúciójára gyakorolt hatásainak azonosítását és megértését . Ez az új kutatási vonal profitál a szekvenált genomok számának növekedéséből és a számítógépes eszközök erejéből. Az összehasonlító genomika egyik fő alkalmazási területe a gének és nem kódoló szabályozó szekvenciáik felfedezése a konzerváció elvén alapulva.
Közös gének
A DNS-szekvenálás feltárta, hogy az emberi genom körülbelül 8% -a eredeti retrovírusos szekvenciákból áll . Ezek az endogén retrovírusok az ősi vírusintegrációk maradványait jelentik, amelyek ma már az emberi genom részét képezik. Ezeknek a szekvenciáknak a többségén számos evolúciós mutáció ment keresztül, amelyek a retrovírust általában hibássá tették , de egyesek megőrizték fertőző erejüket, sőt szerepet játszanak bizonyos , az emberi szaporodáshoz és fejlődéshez kapcsolódó fiziológiai aspektusokban is (például az emberi HERV-W , amely részt vesz a placenta kialakulását biztosító mechanizmusok egyikében ).
Ez a szekvenálás azt is feltárta, hogy az állatok és a növények gének legalább 25% -át megosztják.
A szekvenálás azt is megmutatja, hogy a modern emberek például a neandervölgyiekkel közös gének 99,7% -ában , a csimpánzban a gének 98% -ában, a makákóban 93% -ban, az egérben 85% -ban, a tehénben, macskában 80% -ban vagy kutya, 70% tengeri sün, 61% gyümölcslégy , 60% csirke, 43% féreg, 40% banán, 35% nárcisz, 25% saláta vagy rizs. Az emberek 26% -a osztozik génjeik élesztővel és 18% a gomb gomba .
Ezek a genetikai távolságra vonatkozó adatok azt mutatják, hogy minden élő fajnak sok közös vonása van (a fenotípus a vertikális, de a horizontális géntranszferekből származó genetikai örökség kifejeződése is), különösen a fenntartásban és az expresszióban részt vevő gének szintjén anyagcserében és a környezet észlelésében, de ezeket még perspektívába kell helyezni, mert a számítások csak azokra a kódoló génekre vonatkoznak, amelyek csak az emberi genom 5% -át (és az emberi genom kevesebb mint 2% -át teszik ki) fehérjét kódol). Ezenkívül a nagy hasonlóság a genotípus szintjén nem feltétlenül jár együtt nagy hasonlósággal a fenotípus szintjén. Ez utóbbi a környezet adott genotípusra gyakorolt hatásából származik, amely jelentős eltéréseket eredményez (a fenotípusos plaszticitás fogalma ). Ez genetikai különbségekből is adódik, amelyek lokalizálódnak a DNS funkcionális aktivitás helyeinek meghatározásában. Végül sok biológiai tulajdonság nem egyetlen gén, hanem több gén aktivitásának eredménye. Nem a genetikai távolság, hanem a gének kombinatorikus és hierarchikus jellege, és valószínűleg bizonyos epigenetikai adatok hozzák létre az élőlények sokféleségét.
Az emberi genom összetétele
Az emberek származását genomi aláírásuk tükrözi. A filogenetikai elemzés A humán genom azt mutatja, hogy a 23.000 emberi gének, genetikai homológiát visszamegy prokarióták számára 37% -át, hogy egysejtű eukarióták 28%, hogy az állatok 16%, a gerincesek számára 13%, és a specifikus a főemlősök 6%.
Megjegyzések és hivatkozások
Megjegyzések
Hivatkozások
-
Anne-Geneviève Marcelin és Vincent Calvez (Jean-Marie Huraux irányításával), Az orvosi virológia értekezése , Párizs, Éditions Estem, 2003, 699 p. ( ISBN 2-84371-203-3 ) , „Feltörekvő emberi retrovírusok”, p. 615
-
(in) T. Domazet-Loso, D. Tautz, " Az emberi genetikai betegségekhez kapcsolódó gének ősi evolúciós eredete " , Mol Biol Evol , vol. 25, n o 12,2008, P. 2699–2707.
-
(in) ES Lander et al., " Az emberi genom kezdeti szekvenálása és elemzése " , Nature , vol. 409, n o 6822,2001. február 15, P. 860–921.
-
(in) Darbeshwar Roy, biotechnológia , Alpha Science International,2010, P. 28..
-
.
-
Alastair Crisp, az Egyesült Királyság Cambridge-i Egyetemének biológusa szerint: „Az élet fája tehát nem a tökéletesen elágazó ágú, széles körben képviselt fa. Valójában inkább egy fojtogató füge , kusza gyökerekkel ” . vö. (en) Alastair Crisp †, Chiara Boschetti †, Malcolm Perry, Alan Tunnacliffe, „ A több vízszintesen megszerzett gén expressziója mind a gerinces, mind a gerinctelen genom jellemzője ” , Genome Biology , vol. 16, n o 50,2015( DOI 10.1186 / s13059-015-0607-3 ).
-
(in) Mihaela Pertea, " Az emberi genom eukromatikus szekvenciájának befejezése " , Genova , repülés. 3, n o 3,2012. június 2, P. 344–360 ( DOI 10,3390 / gének3030344 ).
-
Bernard Swynghedauw, amikor a gén ütközik a környezetével , Armando Editore,2009, P. 15.
-
emberi származást a genomi aláírás tükrözi, az ábra Margaret McFall-Ngaia et al. , 2013
-
(in) Margaret McFall-NGAIA munkatársai, " Állatok bakteriális világ, egy új elengedhetetlen az élettudományok " , Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol. 110, n o 9,2013. február 26, P. 3229–3236 ( DOI 10.1073 / pnas.1218525110 ).
Lásd is
Kapcsolódó cikkek
Bibliográfia
-
(en) Kellis M, Patterson N, Endrizzi M, Birren B, Lander E (2003). „Élesztőfajok szekvenálása és összehasonlítása a gének és a szabályozó elemek azonosítása érdekében” Nature , p. 241–254 .
- Cliften P, Sudarsanam P, Desikan A (2003). „Funkcionális jellemzők megtalálása a Saccharomyces genomokban filogenetikai lábnyom alapján”, Science , p. 71–76 .
-
( fr ) Hardison RC. (2003). „Összehasonlító genomika”, PLoS biológia , 1 (2): e58.
-
( fr ) Stein LD és mtsai. (2003). „A Caenorhabditis briggsae genomszekvenciája : az összehasonlító genomika platformja”. PLoS Biology , 1 (2): E45. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0000045
-
(en) Boffeli D, McAuliffe J, Ovcharenko D, Lewis KD, Ovcharenko I, Pachter L, Rubin EM (2003). „A prímásszekvenciák filogenetikai árnyékolása az emberi genom funkcionális régióinak megtalálásához”, Science , 299 (5611): 1391-1394.
-
(en) Dujon B és mtsai. (2004). "Genom evolúció élesztőkben", Nature , 430: 35-44.
-
(en) Filipski A, Kumar S (2005). „Összehasonlító genomika az eukariótákban”: A genom evolúciója (szerk. TR Gregory), p. 521–583 . Elsevier, San Diego.
-
(en) Gregory TR, DeSalle R (2005). „Összehasonlító genomika prokariótákban”: A genom evolúciója (szerk. TR Gregory), p. 585–675 . Elsevier, San Diego.
-
(en) Xie X, Lu J. Kulbokas EJ, Golub T, Mootha V, Lindblad-Toh K, Lander E, Kellis M (2005). „A szabályozó motívumok szisztematikus felfedezése humán promoterekben és 3 'UTR-kben, több emlős összehasonlításával”, Nature .
-
(en) Champ PC, Binnewies TT, Nielsen N, Zinman G, Kiil K, Wu H, Bohlin J, Ussery DW (2006). „ Genomfrissítés: purinszál torzítása 280 baktérium kromoszómában ” Microbiology , 152 (3): 579-583 . HubMed
Külső linkek