A strukturális genomika (vagy strukturális genomika) egy új tudományág a genomika után (az élőlények örökletes anyagának tanulmányozása).
Kifejezetten az a célja, hogy a megadott genom által kódolt összes fehérje háromdimenziós struktúráját szisztematikusan leírja, a röntgensugárral és az NMR - rel végzett kristálytan biofizikai technikáinak felhasználásával . A genomok teljes szekvenálásának köszönhetően hozzáférhetünk valamennyi génjük szekvenciájához, és a megfelelő fehérjék szerkezetének tanulmányozása gyorsabban elvégezhető.