Genetikai marker

A genetikai marker egy gén vagy polimorf DNS- szekvencia , amely a kromoszóma ismert helye alapján könnyen detektálható . A genetikai feltérképezésben felhasználható a genom „jelölésére” és az egyedek vagy fajok azonosítására.

A genetikai marker leírható variációként (amely mutáció vagy genomi lokuszok megváltozása miatt következhet be ), amely megfigyelhető. A genetikai marker lehet egy rövid DNS-szekvencia, például egy szekvencia körül egyetlen bázis pár (egypontos nukleotid polimorfizmus, SNP ), vagy ismétlődő szekvenciák ( VNTR ), mint például a miniszatellit .

1980- ig a genetikai markerek morfológiai jellegűek voltak, mert csak a fenotípusok elemzéséből feltérképezett polimorf géneken alapultak . Az új biotechnológiák ( PCR stb.) Lehetővé teszik a DNS-szekvenciák polimorfizmusának közvetlen elemzését genetikai térkép elkészítéséhez ( molekuláris markerek - közvetlenül DNS vagy biokémiai).

Markerek típusai

Különböző típusú markerek léteznek:

• RFLP , korlátozási töredékhosszú polimorfizmus,
• AFLP , amplifikált töredékhosszú polimorfizmus
• SSLP , egyszerű szekvencia hosszúságú polimorfizmus
• RAPD , a polimorf DNS véletlenszerű amplifikációja
• SNP , nukleotid polimorfizmus,
• SSCP , egyszálú konformációs polimorfizmus
• EST , expressz szekvenciajelző,
• CNV , a másolatok számának változékonysága,
• VNTR , ismételt szekvencia
  • SSR (egyszerű szekvenciaismétlés) vagy mikroszatellit polimorfizmus ,
  • minisatellit ,
  • STS , Szekvenciával címkézett webhely

Jellemzők

Bretting és Widrlechner (1995) szerint a genetikai marker ideális feltételei:

• polimorfnak kell lennie annak érdekében, hogy könnyen meg lehessen különböztetni az egyéneket vagy a nemzetségeket;
• legyen viszonylag "semleges", mind a vizsgált tulajdonság, mind a szelektív érték tekintetében  ;
• legyen kodomináns , hogy megkülönböztesse a heterozigótákat a homozigótáktól  ;
• egyszerű öröklött mendeli tulajdonság legyen ;
• ne legyen pleiotróp vagy episztatikus  ;
• szétszóródnak a genom mentén;
• nem kapcsolódhat más markerhez;
• stabilnak kell lennie, függetlenül a fejlettség szintjétől;
• nem befolyásolhatja a növekedést vagy a nemi szaporodást;
• könnyen megfigyelhető legyen, esetleges kétértelműség nélkül;
• legyen olcsó;

A jelölők osztályozása

Három csoportba sorolhatók attól függően, hogy felfedik-e:

• a kodominancia vagy domináns allél
• szekvenciák vagy ismétlődő egységek polimorfizmusa
• egy lokusz , egy adott régió vagy egész régiók ( genetikai profil , telített genetikai térképek ).

Megjegyzések és hivatkozások

1. Daniel Prat és mtsai, Genomelemzés és erdei genetikai erőforrások kezelése [ olvasható online ] , pp. 73-74., Szerk. Quae, 2006, 456 o. ( ISBN  2738012272 ) .
2. D. De Vienne és S. Santoni , "  A molekuláris markerek fő forrásai  ", molekuláris markerek a genetikában ,1998, P.  49-79

Nem szabad összekeverni

• Marker gén , amely a genetikai transzformáció kontrolljaként szolgál,
• Biológiai marker , az ökológiai zavarok tanúja,