Genetikai marker
A genetikai marker egy gén vagy polimorf DNS- szekvencia , amely a kromoszóma ismert helye alapján könnyen detektálható . A genetikai feltérképezésben felhasználható a genom „jelölésére” és az egyedek vagy fajok azonosítására.
A genetikai marker leírható variációként (amely mutáció vagy genomi lokuszok megváltozása miatt következhet be ), amely megfigyelhető. A genetikai marker lehet egy rövid DNS-szekvencia, például egy szekvencia körül egyetlen bázis pár (egypontos nukleotid polimorfizmus, SNP ), vagy ismétlődő szekvenciák ( VNTR ), mint például a miniszatellit .
1980- ig a genetikai markerek morfológiai jellegűek voltak, mert csak a fenotípusok elemzéséből feltérképezett polimorf géneken alapultak . Az új biotechnológiák ( PCR stb.) Lehetővé teszik a DNS-szekvenciák polimorfizmusának közvetlen elemzését genetikai térkép elkészítéséhez ( molekuláris markerek - közvetlenül DNS vagy biokémiai).
Markerek típusai
Különböző típusú markerek léteznek:
-
RFLP , korlátozási töredékhosszú polimorfizmus,
-
AFLP , amplifikált töredékhosszú polimorfizmus
-
SSLP , egyszerű szekvencia hosszúságú polimorfizmus
-
RAPD , a polimorf DNS véletlenszerű amplifikációja
-
SNP , nukleotid polimorfizmus,
-
SSCP , egyszálú konformációs polimorfizmus
-
EST , expressz szekvenciajelző,
-
CNV , a másolatok számának változékonysága,
-
VNTR , ismételt szekvencia
Jellemzők
Bretting és Widrlechner (1995) szerint a genetikai marker ideális feltételei:
- polimorfnak kell lennie annak érdekében, hogy könnyen meg lehessen különböztetni az egyéneket vagy a nemzetségeket;
- legyen viszonylag "semleges", mind a vizsgált tulajdonság, mind a szelektív érték tekintetében ;
- legyen kodomináns , hogy megkülönböztesse a heterozigótákat a homozigótáktól ;
- egyszerű öröklött mendeli tulajdonság legyen ;
- ne legyen pleiotróp vagy episztatikus ;
- szétszóródnak a genom mentén;
- nem kapcsolódhat más markerhez;
- stabilnak kell lennie, függetlenül a fejlettség szintjétől;
- nem befolyásolhatja a növekedést vagy a nemi szaporodást;
- könnyen megfigyelhető legyen, esetleges kétértelműség nélkül;
- legyen olcsó;
A jelölők osztályozása
Három csoportba sorolhatók attól függően, hogy felfedik-e:
Megjegyzések és hivatkozások
-
Daniel Prat és mtsai, Genomelemzés és erdei genetikai erőforrások kezelése [ olvasható online ] , pp. 73-74., Szerk. Quae, 2006, 456 o. ( ISBN 2738012272 ) .
-
D. De Vienne és S. Santoni , " A molekuláris markerek fő forrásai ", molekuláris markerek a genetikában ,1998, P. 49-79
Nem szabad összekeverni