Szervező (biológia)

A promóter vagy promóter szekvencia a DNS régiója, amely egy gén közelében helyezkedik el, és elengedhetetlen a DNS RNS- be történő átírásához . A promoter az a DNS-terület, amelyhez az RNS-polimeráz kezdetben kötődik , mielőtt megkezdené az RNS-szintézist. A promóter szekvenciák általában a transzkripció kezdő helyétől felfelé helyezkednek el. A promóter számos szekvenciából is áll, amelyek szabályozzák a gén expresszióját, akár egy szövetre vagy szövetcsoportra specifikusak, akár mindenütt, azaz azonosak minden szövet esetében. A gén szintjén vannak olyan fehérje- vagy transzkripciós funkciók is, amelyek kölcsönhatásba lépnek ezekkel a szabályozó szekvenciákkal a gén expressziójának modulálásához. A promóter megtalálható az 1. exon előtt.

Az RNS-polimeráz megkötését és aktiválását transzkripciós faktorok (transz-szabályozó elemek) vezérlik, amelyek specifikus cisz-szabályozó szekvenciákhoz kötődnek, amelyeket klasszikusan "fokozónak" és "hangtompítónak" neveznek, és amelyek a transzkripció kezdőpontjától eltérő távolságra vannak. A transzkripciós faktorok lehetnek a transzkripció aktivátorai vagy represszorai . Ezenkívül a DNS nem szabad a sejtmagban, hanem egy speciális struktúrába tekeredik, amelyet nukleoszómának neveznek, és amely nem hiszton fehérjékhez kapcsolódik . Ennek a kromatinszerkezetnek a kondenzációs állapota a gének promótereinek szintjén feltételezi transzkripciójukat.

A különböző promóter régiók szekvenciájának elemzéséből konszenzus szekvenciákat hoztak létre, amelyeknek több fajtája van. Az első prokariótákban felfedezett szekvencia a "Box" vagy Pribnow-féle doboz , amely egyenértékű az eukarióták TATA-dobozával . Ez a szekvencia, amelynek konszenzusa a TATAAT, 10 nukleotid felett helyezkedik el a transzkripció kezdő helyétől.

Ezeket a szekvenciákat használjuk a gének előrejelzésére .

Prokarióta promóter szekvenciák

<-- amont aval --> 5'-XXXXXXXPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3' -35 -10 gène d'intérêt

A kanonikus bakteriális promóterek két konzervált szekvenciájú "dobozból" állnak: a -35 dobozból és a Pribnow dobozból vagy a -10 dobozból, amelyek körülbelül 35, illetve 10 nukleotid felett helyezkednek el az RNS-ből átírt első nukleotid előtt. Az -35 és -10 régiók közötti optimális távolság 17 nukleotid . Az alábbiakban összefoglalt két kanonikus szekvencia többé-kevésbé konzervált, ami a transzkripció intenzitásának modulálására szolgál. Az erős promoterek nagyon közel vannak az ideális szekvenciához, a gyenge promóterek távolabb vannak tőle.

Az egyes nukleotidok megfigyelésének valószínűsége

séquence en -10 T A T A A T 77 % 76 % 60 % 61 % 56 % 82 % séquence en -35 T T G A C A 69 % 79 % 61 % 56 % 54 % 54 %

Eukarióta promóter szekvenciák

A promóter szekvenciák szervezése nagyon különbözik a prokarióták és az eukarióták között . Az eukariótákban sokkal összetettebb.

Az eukarióta mRNS-ek promóterén ( fő elemek ) számos fő elem található :

Ezeket az elemeket azonban nem minden eukarióta promóter figyeli meg, és nem szükségesek a transzkripció megindításához .

Megjegyzések és hivatkozások

  1. Sejtbiológia, Dunod 2 e ed, JC Callen, p87 és Cellular and Molecular Biology, Dunod 2 e ed, Bolsover, Hyams, Shepard, White, Wiedemann, p120
  2. D. Pribnow (1975) nukleotid-szekvenciája egy RNS-polimeráz kötőhelyet korai T7 promotert, Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 72 : 784-788
  3. C. B. Harley és RP Reynolds , „  Az E. coli promoterszekvenciák elemzése  ”, Nucleic Acids Research , vol.  15, n o  5,1987. március 11, P.  2343–2361 ( ISSN  0305-1048 , PMID  3550697 , PMCID  PMC340638 , online olvasás , hozzáférés : 2017. február 14. )

Lásd is