A biokémia , szekvenálás meghatározásából áll lineáris sorrendben a komponensek egy makromolekula (a aminosavak egy fehérje , a nukleotidok egy nukleinsav , például DNS-t , a monoszacharidok egy poliszacharid , stb).
A genetika , szekvenálás meghatározására vonatkozik a szekvencia a gének , vagy akár a kromoszómák , vagy akár a teljes genom , amely technikailag összege végző szekvenálása a DNS alkotó Ezeket a géneket vagy ezeken a kromoszómákon.
A DNS- szekvenálás abból áll, hogy meghatározzuk egy adott DNS-fragmens nukleotidjainak sorrendjét. A DNS-szekvenálás nagy részét Sanger- módszerrel hajtották végre . Ez a technika a DNS és egy teljesen mesterségesen szintetizált enzim (korábban Klenow-fragmens ) "szekvenáz" és a dideoxiribonukleotidok (ddNTP) polimerizációs reakcióját használja . Az új technikák, például a piroszekvenálás azonban egyre nagyobb szerepet kaptak a szekvenálási piacon. A piroszekvenálást ma már jobban használják a genomra vonatkozó adatok előállítására, mint a Sanger-szekvenálást, mivel ez lehetővé teszi a genom gyors szekvenálását.
A szekvencia a DNS tartalmazza a szükséges információkat élőlény túlélni és szaporodni. Ennek a sorrendnek a meghatározása ezért hasznos mind az organizmusok életmódjának megismerésére irányuló kutatások, mind az alkalmazott alanyok számára. Az orvostudományban fel lehet használni a genetikai betegségek azonosítására, diagnosztizálására és potenciális kezelésére. A biotechnológia egy virágzó tudományág, amely számos hasznos termékre és szolgáltatásra kínál lehetőséget.
A piroszekvenálás olyan módszer, amely a nukleotidok beépítése során bekövetkező pirofoszfát-felszabadulás detektálásán alapul. A DNS-szálat először PCR-rel kell amplifikálni a szekvenálás előtt. Ezután a nukleotidok hozzáadásának sorrendjét választjuk meg a szekvenszerben (azaz a GATC-ban). Amikor egy specifikus nukleotidot adunk a láncba DNS-polimeráz segítségével, egy pirofoszfát szabadul fel és ATP-szulfuriláz révén ATP-vé alakul. Az ATP ezután serkenti a luciferin luciferázissá történő oxidációját, ez a reakció fényjelet generál, amelyet csúcs formájában rögzítenek. Az egyes nukleotidok beépülése ezután korrelál egy szignállal. A fényjel arányos a DNS-szál szintézise során beépített nukleotidok mennyiségével (két beépített nukleotid két csúcsnak felel meg). Ha a hozzáadott nukleotidok nem épülnek be a DNS-molekulába, nem rögzítenek jelet. Ez a technika nem igényel fluoreszcensen jelölt nukleotidokat vagy gélelektroforézist.
Noha az oligoszacharidok és a poliszacharidok szintén biopolimerek , nem olyan gyakori a poliszacharid "szekvenálásáról" beszélni, több okból is. Bár sok poliszacharid lineáris, sokuknak van következménye. Számos különféle egység ( egyedi monoszacharid ) használható és kapcsolható össze különböző módon. Az oligoszacharidok és poliszacharidok szerkezetének meghatározására szolgáló módszerek közé tartozik az NMR spektroszkópia és a metilációs elemzés.