Súlyos akut légzőszervi szindróma koronavírus
SARS-CoV A pásztázó elektronmikroszkóppal látható SARS-CoV vírus virionok . SARS-CoVA súlyos akut légzési szindróma koronavírusa vagy a SARS-CoV (a súlyos akut légzési szindróma koronavírus rövidítése ) (néha a SARS-CoV-1 a jó megkülönböztetésére a SARS-CoV-2 -től 2019 -ben jelent meg ) a koronavírus, amely a súlyos akut légzési szindróma (SARS), amely 2002- től 2004- ig tartott . Ez egy törzs a SARSr koronavírus koronavírus fajok (a SARS -rokon koronavírus , vagy „koronavírus kapcsolódó SARS ” ). Ez fertőző ágens jelent volna meg november 2002 a tartomány Guangdong , a China . Két 1 -jén november 2002 és 31 augusztus 2003 , a vírus fertőzte 8096 ember harminc országban, ami 774 halálesetet, főleg Kínában, Hong Kong , a tajvani és Délkelet-Ázsiában .
Ez egy RNS-vírus egyláncú a polaritású pozitív (csoportja IV a Baltimore osztályozás ) tartozó műfaj a Betacoronavirus . Ez becsomagolt virus egy genom körülbelül 29,7 kilobázis hosszú , amely az egyik legnagyobb genomok közötti RNS -vírusok . 14 fehérjét kódoló 13 gént azonosítottunk . Az 5'-UTR régió 265 nukleotiddal rendelkezik, míg a 3'-UTR régió 342 nukleotiddal rendelkezik. Hasonlóan más koronavírusokhoz , ennek a genomnak az expressziója két nagy nyílt leolvasási keret ( ORF ) transzkripciójával kezdődik, amelyek 1a. És 1b. amelyeket fordította át poliproteineknek .
Több ilyen fehérje működését ismerjük. Az 1a és 1b nyitott leolvasási keretek az RNS-polimeráz RNS-függő és négy fő szerkezeti fehérjét kódolják: a nukleokapszid N-fehérjét , a tüske S-fehérjét, az M-fehérje membránt és a burok E-fehérjét . Nyolc úgynevezett kiegészítő fehérje is létezik, egyik sem rendelkezik ismert homológgal . Ezeknek a kiegészítő fehérjéknek a funkciója homályban marad.
A koronavírus általában a pp1a és a pp1ab poliproteineket fejezi ki nyitott 1a és 1b olvasási kerettel. Ezeket a poliproteineket ezután az ORF 1a-ban kódolt enzimek dolgozzák fel . A poliproteinek ezen enzimekkel történő kezeléséből származó fehérjék között számos replikációs enzim található , például RNS-függő RNS-polimeráz , helikáz és peptidáz . A koronavírus replikációs komplex felelős továbbá az 1b nyitott leolvasási kerettől lefelé tartó különféle hírvivő RNS-ek szintéziséért , amelyek strukturális és kiegészítő fehérjéket hoznak létre. Két különálló fehérje, a 3CLpro és a PL2pro hasít nagy poliproteineket 16 kisebb alegységbe . Ez a genom nem tartalmaz hemagglutinin-észterázt kódoló gént, amely a II . Osztályú koronavírusokban található .
A SARS-CoV egy spirális alakú nukleokapszidból áll, amelyet RNS- genomja alkot, kölcsönhatásba lépve az N nevű fehérjékkel. Ezt a nukleokapszidot kapszid és burok veszi körül , amelyet az E, M, S szerkezeti fehérjék és a kezdő virionból származó lipidek alkotnak. .
Elfoglaló közel kétharmada a genom, a replikáz gén tartalmaz két nyitott leolvasási keretet , az ORF 1A és az 1B, kódoló két poliproteinek elemzi pp1a és pp1b. A pp1b expressziója függ az olvasási keret -1 eltolódásától, amelyet a riboszóma hajt végre a pp1a stop kodonjától kissé feljebb . Ezt a két poliproteint ezután két vírusos proteáz (3CLpro és PL2pro) hasítja, így különböző termékeket kapnak, beleértve a virális helikázt és a polimerázt, valamint bizonyos mennyiségű nem strukturális fehérjét, amelyek sokak számára szerepet játszanának a genom replikációjában. .
A nukleokapszid N-fehérje egy olyan fehérje, amely megtalálható mind a magban , mind a citoplazmában, és amely a SARS-CoV több funkciójával is összefüggésben van. Először a virion összeszerelése során kapcsolódik a vírus RNS-hez , és ezáltal lehetővé teszi a benne lévő genom csomagolását. Ezeket a funkciókat egy RNS-kötő domén teszi lehetővé az N-terminális részben és egy olyan domén, amely lehetővé teszi az N dimerekhez való asszociálódását és más önasszociációs formákat. Az N különféle gazdafehérjékhez is kötődik, beleértve a ciklofilin A-t (Cyp A) és az ribonukleoproteint A1, ami fontosabb szerepet sugall, mint pusztán a vírusszerkezet. Ezenkívül a nukleokapszid fehérje részt vesz a különféle sejtes jelátviteli útvonalak modulációjában azáltal, hogy szabályozza ezen útvonalak egyes szereplőinek, például az ERK, a MAPK vagy a JNK expresszióját. Ezek a változások magukban foglalják az apoptózis indukcióját , valamint a citoszkeleton átszervezését .
E fehérjeAz E fehérje (boríték), amint a neve is mutatja, a vírusburok fő alkotóeleme. Ehhez rendkívül hidrofób szerkezetű, és ez a jellemző lehetővé teheti a fertőzött sejt permeabilitásának módosítását azáltal, hogy pórusokat képez a plazmamembránon . 76 aminosav hosszú, E főleg az endoplazmatikus retikulumban , a Golgi-készülékben és a membránban lokalizálódik a fertőzött emlős sejtekben.
M fehérjeA mátrixfehérje hasonló a többi koronavírusban találhatóhoz, három átjárású transzmembrán doménnel, valamint hosszú karboxiterminális részgel rendelkezik, amely kölcsönhatásba léphet a magfehérjével. Az M fehérje szerepet játszik a vírus összeállításában, függetlenül attól, hogy be van-e burkolva a folyamatba. Ez a fehérje a virionok felszínén található meg a legtöbbet. Következésképpen a fehérje ellen antitestek találhatók a betegek szérumában.
S fehérjeAz S-fehérje (spicule) az I. osztályba tartozó vírusfúziós fehérje, hasonlóan ennek az osztálynak a többi tagjához, ennek is két alegysége van (S1 és S2 néven) és ön-asszociáltak a vírus felszínén található trimerekben. Az S1 alegység fúziós receptorként felismeri az angiotenzin-2 konvertáló enzimet (ACE-2), de felismerhet más receptorokat is, például a C típusú lektin CD209L-t (L-SIGN), ez megmagyarázhatja az ACE-2 negatív tropizmusát sejttípusok. Ez a sejtreceptorral való kapcsolat lehetővé teszi az S2-n lévő fúziós peptid beillesztését, és a membrán és a vírusburok közötti fúzió révén a vírus bejutásához vezet a sejtbe. A gazdasejt különböző jelátviteli útvonalaival való interakciók, beleértve az apoptózis indukcióját, a gyulladásos citokintermelést és a ciklooxigenáz-2 expressziót, szintén társulnak az S fehérjéhez. Úgy tűnik, hogy felelős az ACE-2 vírusfertőzés utáni csökkentéséért is. Ez a fő fehérjeindukáló ellenanyag in vivo is .
A többi nem strukturális fehérje, vagy az nsp (a nem strukturális fehérjék esetében) koronavírus fehérje, amelyre nincs szükség az in vitro replikációhoz , de faji szintű megőrzésük szerepet játszik a vírus in vivo replikációjában és patogenezisében egyaránt. A SARS-CoV-nek több nsp-je van, de közülük kevésnek van jól meghatározott funkciója.
Az új gazdaszervezet vírussal történő fertőzése először a légzőrendszeren keresztül történik, leggyakrabban a fertőzött váladékokkal vagy aeroszollal való érintkezés útján. Sporadikus esetekről számoltak be levegőben és székletben. Az S-fehérje tropizmusa az ACE-2-re lehetővé teszi a vírus bejutását a hörgő hámsejtjeibe . Ez a fertőzés azonban önmagában nem magyarázhatja a 2003-as járvány során gyűjtött kóros adatokat, sőt, a betegek többségében az emésztőrendszeri limfoid szövetek, a másodlagos limfoid szervek és az immunvérsejtek ( lép , nyirokcsomók ) károsodását azonosították. Úgy tűnik, hogy az immunrendszer szerepe jelentős szerepet játszik a vírus patogenezisében, és a SARS-fertőzés egyik legkorábbi jele a lymphopenia , amelyet diagnosztikai és prognosztikai markerként lehetett volna használni a 2003-as járvány során, mivel az immunrendszer károsodása súlyosbodhat. légzési tünetek.
Az emésztőrendszeri hám, a máj és a vesék károsodása szintén magyarázhatja a légzőszervi (hasmenés, hematuria ) egyéb tünetek előfordulását a vírusban szenvedőknél, valamint a vírus jelenlétét a vizeletben és a székletben.
A vírus elleni gazdaszervezet az immunitás veleszületett és megszerzett ágait egyaránt magában foglalja. A megszerzett ág lehetővé teszi antitestek termelését B-limfocitákon keresztül és a fertőzött sejtek pusztulását CD8 + T- limfocitákon keresztül . A vírus bejutását semlegesítő antitestek főleg az S fehérje ellen irányulnak, a veleszületett válasz, amelyet különösen a makrofágok, a komplement és az interferonok közvetítenek, mindenekelőtt a fertőzés korai szakaszában vesz részt. Számos koronavírus képes modulálni ezt a választ, és a SARS-CoV nem tűnik kivételnek.
A diagnosztikai vizsgálatokat a különböző vírusos komponensek kimutatásával hajtják végre. A vírusos RNS kimutatható egy mintában RT-PCR alkalmazásával . Az ezzel a módszerrel leggyakrabban amplifikált gének a replikáz komplex génje vagy a nukleokapszid gének. A vírusantigének kimutatása a beteg váladékában ELISA-val végezhető . A leggyakoribb vírusantigén, a nukleokapszid, három ellenanyag kombinációját alkalmazták e fehérje ellen. Végül a vírust felismerő antitestek kimutatása lehetséges, bár ennek a módszernek van néhány hátránya: az antitestek viszonylag későn jelennek meg a betegségben, és egy ideig fennmaradhatnak a gyógyuló betegek vérében, ami kevésbé specifikus módszerré teszi, és lassabb mint a többiek.
Mivel a SARS-CoV vírus, az antibiotikumok és a bakteriofágok alkalmatlanok: csak bakteriális patológiákat kezelnek.
Mivel az egészségügyi szakemberek soha nem találkoztak a SARS-CoV-vel, amikor az először megjelent, különféle kezeléseket alkalmaztak a SARS-járvány megfékezésére. Közülük a leggyakoribbak voltak: a ribavirin , egy nukleotid-analóg, szteroid gyulladáscsökkentő gyógyszerek, valamint a kórokozó és az érzékenységi szűrők hivatalos azonosítása után az alfa-interferon és a proteáz inhibitorok . E kezelések hatékonysága azonban megkérdőjelezhető, mivel nem végeztek velük megfelelő klinikai vizsgálatokat. A rendelkezésre álló vizsgálatok elemzése kimutatta, hogy nagy részük továbbra sem meggyőző, mivel kis számú alanyon, vagy protokoll és rögzített dózisok nélkül végezték őket, néhányan azt is jelezték, hogy a kezelések károsak lehetnek a vírus felszámolására. Ami az oltásokat illeti, a járvány gyors felszámolása nem hagyott sok teret a klinikai vizsgálatoknak. Az inaktivált vakcinát , valamint az S és N fehérjéken alapuló vakcinákat évek óta tanulmányozzák.