A biológiában az operatív taxonómiai egység (rövidítve OTU , az angol Operational Taxonomic Unit után ) operatív meghatározás, amely a filogenetikailag közeli személyek csoportosítására szolgál .
A kifejezést Robert R. Sokal és Peter HA Sneath alkotta meg a digitális taxonómia összefüggésében , és hasonlóságokkal rendelkező, vizsgált egyének csoportjára utal.
Ma az OTU kifejezés egy általában nem tenyésztett vagy azonosítatlan organizmusok csoportjára utal , amelyek egy adott gén DNS-szekvenciájának hasonlósága alapján csoportosulnak , amely taxonómiai markerként szolgál. A mikrobiális ökológia , a kifejezés OTU gyakran használják mint egyenértékű fogalmának fajok , hiánya miatt egy osztályozási rendszer a baktériumok és archaea . Az OTU-k a mikrobiális biodiverzitás számszerűsítéséhez a leggyakrabban használt mértékegységek .
A szekvenciákat adat particionálás ( csoportosítás ) szerint csoportosítják hasonlóságuk szerint, és az OTU-kat a kutató által választott hasonlósági küszöb alapján határozzák meg (általában 97%). A főleg gének a baktériumok és az archeák 16S rRNS- je, valamint a gombákban lévő belső transzkriptált távtartó (ITS) .
Az, hogy az OTU-k tükrözik-e a mikroorganizmusok tényleges ökológiáját vagy filogenitását, továbbra is vitatott. Ennek ellenére a mikrobiális OTU-k következetes ökológiát mutatnak a különböző élőhelyek között, még akkor is, ha különböző klaszterezési módszerekkel számolják őket.
Az OTU fogalma a filotípus fogalmából származik , de az egyéncsoportok felépítésének módszerével különbözteti meg. Az OTU megközelítésben a DNS-szekvenciákat egymáshoz való hasonlóságuk szerint csoportosítjuk. A filotípusokat úgy határozzuk meg, hogy a DNS-szekvenciákat egy referencia-DNS-szekvenciával együtt csoportosítjuk, amelyek egy már létező adathalmazhoz tartoznak, és amelyekhez gyakran egy fajnév is kapcsolódik.