N- Formil-metionin | |
![]() Az ( S ) -N- formil-metionin szerkezete |
|
Azonosítás | |
---|---|
IUPAC név | ( S ) -2-formamido-4-metil-szulfanil-butánsav |
Szinonimák |
formil-metionin |
N o CAS | |
PubChem | 911 |
Mosoly |
CSCCC (C (= O) O) NC = O , |
InChI |
InChI: InChI = 1S / C6H11NO3S / c1-11-3-2-5 (6 (9) 10) 7-4-8 / h4-5H, 2-3H2,1H3, (H, 7,8) ( H, 9,10) InChIKey: PYUSHNKNPOHWEZ-UHFFFAOYSA-N Std. InChI: InChI = 1 / C6H11NO3S / c1-11-3-2-5 (6 (9) 10) 7-4-8 / h4-5H, 2-3H2,1H3, (H, 7,8) ( H, 9,10) / t5- / m0 / s1 / f / h 7,9 . InChIKey: PYUSHNKNPOHWEZ-VFDKKNNSDA |
Kémiai tulajdonságok | |
Képlet |
C 6 H 11 N O 3 S [-izomer] |
Moláris tömeg | 177,221 ± 0,012 g / mol C 40,66%, H 6,26%, N 7,9%, O 27,08%, S 18,09%, |
Egység SI és STP hiányában. | |
Az N -formylméthionine , rövidített fMet , egy származéka aminosav proteinogén . A metioninból származik, az aldehid- CHO funkciós csoportot az a- aminhoz kötve . Ez részt vesz a megindítását protein bioszintézis által riboszómák a baktériumok , mitokondrium és kloroplasztisz - de nem archaea vagy a citoszolban az eukarióták -, és általában megszűnik a fehérje végén szintézisének. Emberben az N- formil-metionint az immunrendszer idegen testként azonosítja, amely immunválaszt vált ki .
Az fMet az első aminosavmaradék, amely a baktériumok fehérjeszintézise során gyűlik össze, és ezért a növekvő polipeptidlánc N végén található . Ez hozta a mRNS - riboszóma komplex (30S) által egy adott transzfer RNS (tRNS-fMet), a antikodonja amelyek 3'- U A C -5 „kötődik az iniciációs kodon 5' Egy U G -3” messenger RNS. Egyéb iniciációs kodonok léteznek a baktériumokban. Megtaláljuk az 5'-GUG-3 'kodont és az 5'-UUG-3' kodont is. Ezek a 2 alternatív kodonok által elismert azonos tRNS-fMet köszönhetően a vobbulációs .
Az N- formil- metionint ugyanaz a kodon kódolja, mint a metionint , az AUG-t , amely egyben a géntranszlion kezdő kodonja : ahol az AUG az iniciációs kodon, ott N- formil- metioninná alakul, de amikor az AUG később megtalálható a nukleinsavbázisban a messenger RNS szekvenciája , ezt a kodont metionin fordítja le. Sok élőlény használja ennek az alapvető mechanizmusnak a variációit.
A metionin N- formilációját metionil-tRNS-formiltranszferáz ( EC ) katalizálja, amint a metionint aminoacil-tRNS-szintetáz segítségével a tRNS.fMet-re töltjük . A metionint tehát mind a tRNS.Met, mind a tRNS.fMet segítségével be lehet tölteni, de csak a tRNS.fMet-re töltött metionint formilezheti transzformiláz.
Az fMet a legtöbb fehérjéből egy peptid deformiláz segítségével eliminálódik, amely lehetővé teszi a formilcsoport, majd egy metionin aminopeptidáz eltávolítását .
Mivel fehérjék kiindulva egy N -formylmethionine maradékot nem lehet szintetizálni a nukleáris genom az eukarióták , reagáltatunk egy N -terminális fMet egy fehérje szolgál diszkrimináns az immunrendszer azonosítására idegen fehérjék. A granulociták tehát egy fMet-maradéktól kiindulva kötődnek a fehérjékhez, és felhasználják őket a fagocitózis folyamatának elindítására .