Rizs sárga tarka vírus

Rizs sárga foltos vírus

Rizs sárga foltos vírus Osztályozás az ICTV szerint
Királyság Riboviria
Uralkodik Orthornavirae
Ág Pisuviricota
Osztály Pisoniviricetes
Rendelés Sobelivirales
Család Solemoviridae
Kedves Sobemovirus

Faj

Rizs sárga foltos vírus
ICTV 1991

Szinonimák

A vírus rizs sárga foltosság (RYMV, rizs sárga foltosság vírus ) egy faj növényi vírusok nemhez tartozó Sobemovirus ( családja a Solemoviridae . Ez egy RNS-vírus , lineáris , egyszálú, pozitív értelemben , kapcsolódik a IV csoport a Baltimore osztályozás Ez a vírus főként rizsnövényeket fertőz meg Afrikában. Ez a vírus okozza a legtöbb kárt az afrikai rizstermesztésben, 20–100% -os termésveszteséget okozva.

Jellemzők

A RYMV a Sobemovirus nemzetségbe tartozik . Ez egy pozitív értelemben vett egyszálú lineáris RNS vírus . Magas szintű genetikai sokféleséget mutat az RYMV nukleotidokkal, becslések szerint körülbelül 14%.

A virion egy burkolatlan részecske, amely egy ikozaéderes szimmetriával (T = 3) rendelkező kvázi gömb alakú kapszidból áll , amelynek átmérője 29-32,2 nm. A kapszid hatszögletű körvonallal jelenik meg.

Az egyrészes genom 4450 nukleotid hosszú, nem poliadenilezett RNS- molekulából áll . Négy nyitott olvasókeretet (ORF) tartalmaz. A genom 5'-végén elhelyezkedő ORF1 egy kis fehérjét kódol, amely részt vesz a vírus mozgásában és a géncsendesítés elnyomásában . Az ORF2-nek, amely a mag poliproteint kódolja, két átfedő ORF van: az ORF2a szerin proteázt és a vírusgenomhoz kapcsolt fehérjét kódol ; ORF2b, ami megmutatkozik egy leolvasási keret eltolódást mechanizmus , mint egy fúziós fehérjét kódol, az RNS-függő RNS-polimeráz (RNS-replikáz). A kapszid fehérje gént (ORF4) szubgenomikus RNS expresszálja a genom 3 'végén. A genom tartalmaz továbbá három nem kódoló régiót (NCR) az 5 '(5' NCR) és a 3 '(3' NCR) végén, valamint az ORF1 és ORF2 között.

A szebemovírusok közül , amelyeket genomiális szervezettségük szerint két csoportra osztottak fel, egyrészt a déli cowpea mozaik vírushoz (SCPMV), másrészt a Cocksfoot mottle vírushoz (CfMV) közel, a RYMV a második csoport.

Szerológiai különbségekről számoltak be az RYMV izolátumok között. Öt fő törzset különböztettek meg Afrikában, hármat Nyugat-Afrikában (S1, S2, S3) és kettőt Kelet-Afrikában (S4, S5). A nukleotidok és aminosavak divergenciája az RYMV öt törzse között akár 11% is lehet.

terjesztés

A rizs sárga tarka vírus endemikus az afrikai kontinensen, ahol a legtöbb rizstermelő országban megtalálható . Törökországból is beszámoltak róla . Ezt a vírust először 1966-ban jelentették Kenyában , és Afrika szubszaharai térségének számos országában észlelték . Közép-Afrikában is kimutatták .

Egy 2002–2003-ban az Edirne régióban végzett szerológiai tesztek felhasználásával végzett felmérés során kiderült, hogy Törökországban a rizs sárga variegation vírus (RYMV) található .

Gazdanövények

Az RYMV gazdanövényeinek köre csak az Oryzeae és az Eragrostideae törzsekhez tartozó vad és termesztett füveket tartalmazza . Ezek közé a növények közé tartozik különösen az Oryza longistaminata , amelyet a fő gazdaszervezetnek tekintenek, az Oryza barthii és az Oryza glaberrima (afrikai rizs) ”.

Különböző tanulmányok kimutatták, hogy az Oryza nemzetség növényein kívül számos fűfaj a RYMV természetes gazdája, és alternatív gazdanövényeket vagy tározó növényeket képezhet , különösen: Dinebra retroflexa , Echinochloa colona , Echinochloa crus-galli , Echinocloa crus- pavonis , Echinocloa pyrimidalis , Eleusine indica , Eragrostis ciliaris , Eragrostis tenuifolia , Ischaemum rugosum , Panicum maximum , Panicum repens .

A fertőzés tünetei

A levelek csíkozása, foltosodása, elszíneződése és fejlődési rendellenességei, valamint a fertőzött palánták pusztulása mind a RYMV-fertőzés jellemző jele.

A fiatal csemeték (3-4 leveles növekedési stádium) a legérzékenyebbek - az idősebb növényeknek általában kevésbé nyilvánvaló a levéltünete és kevésbé akadoznak, mint a fiatalabb növényeknél. A tünetek kezdetben lineáris sárga-zöld foltokként jelennek meg a fiatalabb levelek tövében. A fertőzés kialakulásával a foltok párhuzamosan húzódnak a levelek ereivel, és sárga vagy narancssárga csíkokként jelennek meg; ezek szélessége eltérő lehet, de 10 cm-ig folyamatos lehet.

Az érintett növények sárga vagy narancssárga levelekkel rendelkeznek a termesztés korai szakaszában. Súlyos esetekben a levelek göndörödnek és kiszáradnak. További tünetek az elakadt növények, a csökkent talajművelés és a panicula rossz töltése. Ennek eredménye kevés gabonatermelés vagy egyáltalán nem, és rossz a gabona minősége.

RYMV fertőzés is lehetnek mellékhatásai formájában gombás támadások különböző gombafaj: Cochliobolus miyabeanus (rizs burgonyavész ), Monographella albescens (levél forrázás), Sarocla-dium oryzae (köpeny rot) és Pyrenochaeta oryzae (= Phoma leveillei , hüvely foltok).

Terjedés

A RYMV vírust ízeltlábúak, pontosabban a Coleoptera rendbe tartozó rovarok , többnyire a Chrysomelidae családba továbbítják . Ezek közé tartozik: Sesselia pusilla , Chaetocnema pulla , Trichispa serica és Dicladispa viridicyanea . Az átvitel félperzisztikus módban történik. A vírus nem replikálódik a vektor organizmusában, és a rovar-vektor elveszíti olvadás közben , és nem veleszületett módon terjed át a vektor utódjaira. A vektor átviteléhez nincs szükség helper vírusra . Kimutatták, hogy a Conocephalus nemzetség szöcskéi ( Tettigoniidae család ) Ugandában a RYMV lehetséges vektorai.

Úgy gondolják, hogy a vírust más állatok, például patkányok, a szél hatására lombtal érintkezve és abiotikus tényezők (például öntözővíz) is átvihetik. Ezt a vírust nem magok vagy fonálférgek nem közvetítik .

A harc módszere

A vírus elleni közvetlen kezelés hiányában a rizs sárga színének csökkentése megelőző intézkedéseket, rovarölők elleni rovarölő kezeléseket és rezisztens fajták alkalmazását foglalja magában .

Ellenálló fajták

Ellenálló és toleráns fajták állnak rendelkezésre

Rovarölő szerek használata

Nem áll rendelkezésre kémiai szabályozási módszer az RYMV terjedésének közvetlen megakadályozására, azonban egyes országokban rovarölő szerek alkalmazhatók a vírusvektorok elleni védekezésre, és ezáltal csökkenthetők a vírusok oltási aránya. A megfelelő vegyszerek a helyi előírásoknak megfelelően változnak. A rovarölő szerek alkalmazásának azonban sajátos hátrányai vannak az afrikai kontextusban. Ez egy drága, nem specifikus módszer (amely ezért a hasznos rovarokat is kiküszöböli), és a rizs hántolókkal kapcsolatos toxicitási kockázatot jelent a vízre és az élelmiszer-növényekre.

Megelőző intézkedések

Ezek az intézkedések elsősorban a termesztési gyakorlatokat érintik .

A vírus terjedésének megakadályozása érdekében ajánlott a korábban nem fertőzött faiskolákban történő vetés, vagy közvetlen vetés a terepen. A CABI azt javasolja, hogy a növényeket a lehető legkorábban ültessék el, hogy elkerüljék a vírus rovarvektorainak csúcsidőszakát. Ezenkívül a különböző szántókra történő telepítés időzítése megakadályozhatja a vírus átterjedését a fiatalabb növényekre.

A rendszeres faiskolák és rizsföldek gyomlálása , a gátak, az öntözőcsatornák és a környező rizsföldek tisztítása, különösen a szezonon kívül, megszüntetheti a vírus alternatív gazdanövényeit. A mezők körüli cserjék tisztítása korlátozza a rovar vektorok szaporodási helyeit, és megakadályozhatja az RYMV terjedését is. A karbantartási műveletek során ajánlatos kerülni az egészséges növények megérintését, miután a kezek érintkeznek a fertőzött növényekkel. A mezőgazdasági gépek minden használat után történő tisztítása csökkentheti a vírus mechanikus terjedését.

A kultúrák megtisztítása abból áll, hogy a faiskolákban és a rizsföldeken is a lehető legkorábban azonosítják a tarka tüneteket mutató csomókat, és égetéssel elpusztítják őket.

A vetésváltás , a rizsnövények és más növények váltakozása, szintén ajánlott a vírus és a rovar vektorok általi fertőzés megtörésére.

Megjegyzések és hivatkozások

  1. ICTV. Nemzetközi Vírusrendszertani Bizottság. Rendszertan története. Megjelent az interneten https://talk.ictvonline.org/., Hozzáférés: 2021. január 23
  2. (in) "  Rice yellow mottle virus  " az ICTVdB-n - Az univerzális vírusadatbázis , ICTV (hozzáférés: 2021. január 10. ) .
  3. (in) Z. Abubakar , "  A rizs sárga foltos vírus filogeográfiája Afrikában  " , Journal of General Virology , vol.  84, n o  3,1 st március 2003, P.  733–743 ( ISSN  0022-1317 , DOI  10.1099 / vir.0.18759-0 ).
  4. .
  5. (en) Fargette D, Pinel A, Abubakar Z, Traoré O, Brugidou C, Fatogoma S, Hébrard E, Choisy M, Séré Y, Fauquet C, Konaté G, „  A rizs sárga folt evolúciós történetének következtetése vírus genomikai, filogenetikai és filogeográfiai vizsgálatokból  ” , Journal of Virology , vol.  78, n o  7,2004. április, P.  3252–61 ( DOI  10.1128 / JVI.78.7.3252-3261.2004 ).
  6. (en) "  Kutatás rizsfoltos kaszkadőr és rizs sárga foltvírusok esetén a törökországi Edirne-ben termesztett rizsen  " ,2004. szeptember( DOI  10.1007 / BF03543325 ) , p.  387-394.
  7. (in) „  Rice Yellow Mottle Virus  ” a Rice Knowledge Bank (RKB) , Nemzetközi Rice Research Institute (IRRI) területén (hozzáférés: 2021. január 10. ) .
  8. (en) Bakker W., Rizs sárga foltos vírus jellemzése és ökológiai vonatkozásai Kenyában. , Wageningen Egyetem,1974( online olvasás ).
  9. (in) "  Rice yellow fottle virus (RYMV) Afrikában: az evolúció, a terjesztés és a gazdasági jelentőség fenntartható rizstermelési és -kezelési stratégiák  " , Journal of Sustainable Agriculture , vol.  11, n csont  2-31997 december, P.  85–111 ( DOI  10.1300 / J064v11n02_08 ).
  10. (in) Ayaka Uke , Naswiru Tibanyendela , Ryoichi Ikeda , Azusa Fujiie és Keiko Teresa Natsuaki , "  A rizs sárga foltos vírusának terjedési és stabilitási módjai  " , Journal of Plant Protection Research , vol.  54, n o  4,2014. december 30, P.  363-366 ( ISSN  1899-007X , DOI  10.2478 / JPP-2014-0054 ).
  11. (en) "  Pest vezetői döntés útmutató: Zöld lista - Rice sárga foltosság betegség  " , a Plantwise Knowledge Bank , CABI (elérhető 11 január 2021 ) .
  12. (en) „  Ellenálló rizs a rizs sárga foltos vírussal szemben  ” , a Plantwise Tudásbankon .
  13. (in) "  Rice yellow mottle virus  " az Invasive Species Compendium (ISC) , CABI (hozzáférés: 2021. január 10. ) .
  14. (in) "  Rizs sárga folt (Ikivejuru)  " a Plantwise Tudásbankon .
  15. (in) „  Rice Yellow Mottle Virus (RYMV) - Ruanda  ” , a Plantwise Tudásbankon .
  16. (en) „  A rizs sárga foltos betegsége - Ghána  ” , a Plantwise Tudásbankon .
  17. Ouattara Bakary, A rizs sárga tarka vírus (RYMV) Nyugat-Afrikában: a törzsek molekuláris jellemzése, a rezisztencia forrásainak azonosítása és a vírus epidemiológiai aspektusainak meghatározása (tézis) , Náci Boni Egyetem (UNB) - Vidékfejlesztési Intézet (IDR),2017. november( online olvasás ).
  18. (en) „  Rizs sárga foltos betegség - Malawi  ” , a Plantwise Tudásbankon .
  19. Abdoul-Aziz Sy, „  A rizs sárga változatossága Afrikában: gazdasági jelentőség és irányítási stratégiák  ” , Académie des Sciences, Inscriptions et Belles-Lettres de Toulouse (hozzáférés : 2021. január 11. ) .

Lásd is

Kapcsolódó cikkek

Bibliográfia

Külső linkek