A cianinok nem szisztematikus neve a polimetin csoportba tartozó szintetikus markerek családjának . A cianinokat számos felhasználás jellemzi fluoreszcens markerként , különösen az orvosbiológiai képalkotásban. Attól függően, hogy a szerkezet, az általuk lefedett egy spektrumot a IR hogy UV .
A cianinokat eredetileg használták és használják a fotonabszorpció érzékenységi tartományának növelésére, vagyis a hullámhossz tartományának növelésére, amely képet alkot a filmen. A cianinokat CD-R és DVD-R lemezeken is használják . A felhasználtak főleg zöld vagy világoskék színűek, kémiailag instabilak. Ezáltal a cianinok nem kompatibilisek a CD és DVD archiválással, mivel néhány év után gyengülnek és olvashatatlanná válnak (azonban a legújabb cianinlemezek tartalmaznak egy stabilizátort, amely jelentősen lelassítja a jelromlást).
A cianinokat először egy évszázaddal ezelőtt szintetizálták, és nagyon sok cikkben tárgyaljuk őket.
háromféle cianin létezik:
ahol 2 atomok a nitrogénatom kapcsolódik egy polimetin lánc. Minden nitrogénatom egymástól függetlenül egy heterociklusos rész, például pirrolok , imidazolok , tiazolok , piridinek , kinolinok , indolok , benzotiazolok stb.
Különböző cianin-fluorofór-családokat használnak fluoreszcens markerként és próbaként a sejtbiológiai elemzés során.
A Cy3 vörösnek tűnik a szem számára, de elnyeli a zöldhöz közeli hullámhosszakat (gerjesztés ~ 550 nm-nél , emissziója sárgákban ~ 570 nm ). Cy5 tűnik türkizkék, hogy a szemet, de elnyeli a narancs (~ 649 nm ), és fluoreszkál távoli vörös (~ 650 / 670 nm ). A Cy3 és Cy5 tipikusan együtt alkalmazható 2 színben (narancssárga és távoli vörös) történő detektálásra különféle technikákban (fluoriméterek, képalkotók, mikroszkópok ...) és módozatokban (abszorpciós fluoreszcencia, FRET, kioltás, hajtű stb.). Néha kék jelölővel (pl. AMCA, PI) vagy zölddel (pl. FITC, világosabb, mint Cy2) kombinálják őket. A Cy7-et különösen in vivo képalkotó alkalmazásokban használják.
A fluoreszcens jelölés elsődleges alkalmazásán túl a cianinok sokféle biológiai alkalmazási lehetőséget nyújtanak, ideértve az összehasonlító genomi hibridizációt és a DNS-mikrosávokat , amelyeket a transzkripptikában , valamint a proteomikában és az RNS lokalizációjában alkalmaznak.
A Cy3 és a Cy3.5 fluoroforok, amelyek a narancs-vörös spektrumban emittálódnak.
A Cy5 és Cy5.5 fluorofórok, amelyek a mélyvörös infravörös spektrumban bocsátanak ki.
A Cy7 és a Cy7.5 a távoli infravörös spektrumban kibocsátó fluorofór.
Fluorofor | Ex ( nm ) | Em ( nm ) | MW | Kvantum mező |
---|---|---|---|---|
Cy2 | 489 | 506 | 714 | QY 0.12 |
Cy3 | (512); 550 | 570; (615) | 767 | QY 0,15 |
Cy3B | 558 | 572; (620) | 658 | QY 0,67 |
Cy3.5 | 581 | 594; (640) | 1102 | QY 0,15 |
Cy5 | (625); 650 | 670 | 792 | QY 0,27 |
Cy5.5 | 675 | 694 | 1128 | QY 0,28 |
Cy7 | 743 | 767 | 818 | QY 0,28 |
Ex (nm): Gerjesztési hullámhossz nanométer
Em (nm): emissziós hullámhossz nm
MW: Molekulatömeg (Molekulatömeg (en))
QY: kvantumhasznosítási (kvantumhasznosítási (en))
Az Alexa Fluor , FluoProbes festékek (in) , DyLight, Seta festékek, Setau, SRfluor és Square festékek a legtöbb alkalmazásban helyettesíthetik a cianinokat.