Brachypodium distachyon

Brachypodium distachyon A kép leírása, az alábbiakban szintén kommentálva Növényi szokás. APG III. Osztályozás (2009)
Uralkodik Plantae
Clade Orrszívók
Clade Egyszikűek
Clade Commelinidae
Rendelés Poales
Család Poaceae
Kedves Brachypodium
Alcsalád Pooideae
Törzs Brachypodieae
Kedves Brachypodium

Faj

Brachypodium distachyon
( L. ) P. Beauv. , 1812

Filogenetikai osztályozás

Filogenetikai osztályozás

Brachypodium Brachypodium egy faj a növények egyszikűek a család a Poaceae , alcsalád a perjeformák , a régi világ ( mediterrán , Nyugat-Ázsia ).

A genom viszonylag kicsi (~ 272 millió bp 5 kromoszóma ) a fű , a kis méret és a ciklus rövid, a közelsége taxonómiai a gabonafélék jelentős ( búza , árpa , zab , rozs azonos alcsaládba perjeformák , és a kukorica , cirok , cukornád , köles , fonio (alcsalád Panicoideae ), valamint a rizs (alcsalád rizsformák ) határoztuk meg a választásra, modellként a fűben genomika .

Etimológia

A generikus név „  Brachypodium  ” alakul a görög gyökerek βραχύς ( brachys ), a rövid és πόδιον ( podion ), kis láb, utalva a nagyon rövid kocsány a spikelets (subsessiles). A sajátos epitett , a "  distachyon  " a görög δίς ( dis ), deux és στάχυς ( stachys ), tüske gyökerekből képződik , hivatkozva a rendszeresen kétágú elágazó virágzatra.

Elterjedés és élőhely

A Brachypodium distachyon eredeti tartománya kiterjed az Óvilágra:

A fajt több kontinensen hozták be és honosították, különösen Kínában és Kelet-Ázsiában, Indiában , Ausztráliában , Észak-Amerikában ( Egyesült Államok és Mexikó ) és Dél-Amerikában .

Száraz és köves talajra adaptált növény.

Modell üzem

Bár Brachypodium distachyon kevéssé mezőgazdasági jelentősége , hogy az olyan faj, amely számos előnye van, mint egy modell organizmus megértéséhez a genetika és a molekuláris és celluláris biológia mérsékelt füvek. A viszonylag kis mérete a genom hasznossá teszi szekvenálás és genetikai térképezés. Ezenkívül a Brachypodium distachyon genomnak csak mintegy 21% -a ismétlődő elemekből áll, szemben a rizs 26% -ával és a búza mintegy 80% -ával, ami tovább egyszerűsíti a genetikai térképezést és szekvenálást. Körülbelül 272 millió bázispárral és öt kromoszómával ez egy kis fűfaj egy genom. A Brachypodium distachyon kis mérete (15-20 cm magas) és gyors életciklusa (nyolc-tizenkét hét) szintén előnyös kutatási célokra. A virágzás, korai csatlakozás esetén, már a csírázás után három héttel megtörténhet ( megfelelő induktív fotoperiódus alatt ). Egyes csatlakozások kis mérete megkönnyíti a kis területen történő termesztést. Gyomnövény jellege megmagyarázza, hogy ez a növény miért nő könnyen, anélkül, hogy speciális termesztési feltételeket szabna meg.

Ez a faj erőteljes modellként jelenik meg, amely az egyre növekvő kutatói közösséget mozgósítja. A Nemzetközi Brachypodium Initiative (IBI) első találkozóját, valamint egy genomikai műhelyt tartott a PAG XIV konferencián, San Diegóban , Kaliforniában , 2006 januárjában. Az IBI célja a Brachypodium distachyon mint modell fejlődésének elősegítése. szervezet és fejleszteni genomi , genetikai és bioinformatikai források , mint például a referencia genotípusok , CBA könyvtárak , genetikai markerek , lakosság feltérképezése és egy adatbázist a genomi szekvenciák . A közelmúltban hatékony Agrobacterium transzformációs rendszereket fejlesztettek ki számos Brachypodium genotípusra , lehetővé téve a mutáns transzfer DNS gyűjtemények fejlesztését . A T-DNS inszerciós vonalak jellemzése és elosztása a füvek génfunkcióinak megértése érdekében

Most a Brachypodium distachyon fontos eszköznek bizonyult az összehasonlító genomika területén . Ez a növény a fitopatológia modelljévé válik , megkönnyítve a betegség-rezisztenciával kapcsolatos ismeretek átadását a mintaszervezetből a termesztett növényfajokba. A Brachypodium distachyon az evolúciós biológia tanulmányozásának hasznos modelljévé is válik , különös tekintettel a molekuláris genetikai mechanizmusok összehasonlítására a kétszikű modell organizmusok, nevezetesen az Arabidopsis thaliana mechanizmusaival .

Rendszertan

Szinonimák

Az Életkatalógus szerint (2017. november 30.)  :


Alfajok és fajták listája

Szerint Tropicos (november 30, 2017) (Figyelmeztetés nyers lista esetleg tartalmazó szinonimák):

Megjegyzések és hivatkozások

  1. (a) L. Watson & MJ Dallwitz "  Brachypodium P. Beauv.  » , A világ füves nemzetségeiről (hozzáférés : 2016. szeptember 9. ) .
  2. .
  3. (a) "  Taxon: Brachypodium distachyon (L.) P. Beauv.  " On Germplasm Resource Information Network (GRIN) (hozzáférés: 2017. november 30. ) .
  4. (in) WD Clayton M. Vorontsova, KT & Harman H. Williamson, "  Brachypodium distachyon  " on GrassBase - The Online World Grass Flora (hozzáférés: 2017. november 30. ) .
  5. (in) "  1. Brachypodium distachyon (Linnaeus) P. Beauvois, Ess. Agrostogr. 155. 1812  ” , Kína Flóráján (hozzáférés : 2017. november 30. ) .
  6. (in) A Nemzetközi Brachypodium Kezdeményezés, "  Genomszekvenálás és a Brachypodium distachyon modellfű elemzése  " , Nature , vol.  463, n o  7282,2010, P.  763–8 ( DOI  10.1038 / nature08747 ).
  7. .
  8. (in) John P. Vogel , David F. Garvin , Oymon Mr. Leong és Daniel M. Hayden , "  Agrobacterium által közvetített transzformációs és fejlődési beltenyésztett vonal a Brachypodium distachyon füves modellben  " , Növényi sejt, szövet- és szervkultúra , repülés .  84, n o  22006, P.  100179–91 ( DOI  10.1007 / s11240-005-9023-9 ).
  9. (a) Philippe Vain , Barbara Worland , Vera Thole , Neil McKenzie , Silvia C. Alves , Magdalena Opanowicz és Lesley J. Fish , "  Agrobacterium által közvetített transzformáció a mérsékelt fű Brachypodium distachyon (genotípus BD21) a T-DNS inszerciós mutagenezis  ” , Plant Biotechnology Journal , vol.  6, N o  5,2008, P.  236–45 ( DOI  10.1111 / j.1467-7652.2007.00308.x ).
  10. (in) Sílvia C. Alves , Barbara Worland , Vera Thole , John W Snape , Michael W Bevan és Philippe Vain , "  A Brachypodium distachyon community BD21 standard line Agrobacterium- mediált átalakításának protokollja  " , Nature Protocols , vol.  4, N o  5,2009, P.  638–49 ( DOI  10.1038 / nprot.2009.30 ).
  11. (in) Vera Thole , Sílvia C. Alves , Barbara Worland , Michael W Bevan és Philippe Vain , "  Protokoll a Brachypodium distachyon T-DNS inszerciós mutánsok határoló szekvencia címkéinek (TSP) hatékony visszakereséséhez és jellemzéséhez  " , Nature Protocols , vol. .  4, N o  5,2009, P.  650–61 ( DOI  10.1038 / nprot.2009.32 ).
  12. (in) Vera Thole , Antoine Peraldi Barbara Worland , Paul Nicholson , John H. Doonan és Philippe Vain , "  T-DNS mutagenesis in Brachypodium distachyon  " , J Exp Bot , vol.  63, n o  22012, P.  567–76 ( DOI  10.1093 / jxb / err333 ).
  13. (in) Vera Thole , Barbara Worland , Jonathan Wright , Michael W. Bevan és Philippe Vain , "  Több mint 1000 T-DNS-tag eloszlása ​​és jellemzése a Brachypodium distachyon közösségi BD21  " vonal genomjában , Plant Biotechnology Journal , járat .  8, n o  6,2010, P.  734–47 ( DOI  10.1111 / j.1467-7652.2010.00518.x ).
  14. (in) Naxin Huo , John P. Vogel , Gerard R. Lazo , Frank M. You , Yaqin Ma , Stephanie McMahon és Jan Dvorak , "  A Brachypodium genom strukturális jellemzése és szinesztikus kapcsolata a rizzsel és a búzával  " , Plant Mol Biol , vol.  70, n csont  1-2,2009, P.  47–61 ( DOI  10.1007 / s11103-009-9456-3 ).
  15. (in) Rachel Goddard , Antoine Peraldi Chris Ridout és Paul Nicholson , "  Enhanced betegség által okozott ellenállás BRI1 mutáció között konzervált Brachypodium distachyon és árpa ( Hordeum vulgare )  " , Mol Plant mikroba Interakció , vol.  27, n o  10,2014, P.  1095–1106 ( DOI  10.1094 / MPMI-03-14-0069-R ).
  16. (in) David Pacheco-Villalobos , Martial Sankar , Karin Ljung és Christian S. Hardtke , "  Disturbed Helyi auxin Javítja sejthomeosztázis és Anisotropy feltárja Alternatív bekötése auxin-etilén áthallást Brachypodium distachyon Seminal Roots  " , PLoS Genetics , vol.  9, n o  6,2013, e1003564 ( DOI  10.1371 / journal.pgen.1003564 ).
  17. Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk PM, Bourgoin T., DeWalt RE, Decock W., van Nieukerken EJ, Penev L. (szerk.) (2020). Species 2000 & ITIS Life Catalogue , 2020-12-01. Digitális erőforrás a www.catalogueoflife.org oldalon . Faj 2000: Naturalis, Leiden, Hollandia. ISSN 2405-8858, hozzáférés: 2017. november 30
  18. Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., Hozzáférés: 2017. november 30

Külső linkek